故事舞臺發生在13年前，在東京秋葉原發生的6名少女離奇失蹤案件“秋葉原神隱”，最終以懸案告終。曾被譽為天才創作者的新城大輝，為迎接一年一度的游戲展，宣布將以該事件為題材開發新作游戲《AKIBA LOST》。然而發表后不久，大輝便接到一通威脅電話：“停止游戲開發，否則悲劇將重演。”擔任游戲參演者之一的大輝妹妹葵也被卷入事件，突然失蹤。大輝被迫面臨終極抉擇：是完成游戲，還是守護妹妹與同伴？